Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PPP1R1AQ13522 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms