Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CSTF3Q12996 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CSTF3Q12996 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CSTF3Q12996 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CSTF3Q12996 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CSTF3Q12996 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CSTF3Q12996 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CSTF3Q12996 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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