Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms