Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms