Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms