Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms