Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms