Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms