Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BACE1P56817 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BACE1P56817 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BACE1P56817 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BACE1P56817 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BACE1P56817 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BACE1P56817 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BACE1P56817 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BACE1P56817 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BACE1P56817 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BACE1P56817 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BACE1P56817 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BACE1P56817 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BACE1P56817 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BACE1P56817 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BACE1P56817 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BACE1P56817 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BACE1P56817 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms