Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN5P54829 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms