Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms