Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTPAP49638 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TTPAP49638 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TTPAP49638 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTPAP49638 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTPAP49638 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTPAP49638 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTPAP49638 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTPAP49638 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTPAP49638 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTPAP49638 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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