Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT6CP48668 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT6CP48668 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KRT6CP48668 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT6CP48668 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT6CP48668 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT6CP48668 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT6CP48668 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT6CP48668 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT6CP48668 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms