Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGCXP38435 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms