Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms