Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PLNP26678 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms