Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms