Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NTF3P20783 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NTF3P20783 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NTF3P20783 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NTF3P20783 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NTF3P20783 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NTF3P20783 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NTF3P20783 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NTF3P20783 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NTF3P20783 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NTF3P20783 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NTF3P20783 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NTF3P20783 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NTF3P20783 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NTF3P20783 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NTF3P20783 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NTF3P20783 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NTF3P20783 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NTF3P20783 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NTF3P20783 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms