Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms