Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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