Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms