Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms