Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1BQ9NZR2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms