Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EMILIN3Q9NT22 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms