Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C20orf27Q9GZN8 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms