Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRACR2AQ9BSW2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms