Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms