Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYCBPQ99417 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYCBPQ99417 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYCBPQ99417 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYCBPQ99417 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MYCBPQ99417 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYCBPQ99417 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYCBPQ99417 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYCBPQ99417 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYCBPQ99417 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYCBPQ99417 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYCBPQ99417 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYCBPQ99417 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MYCBPQ99417 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MYCBPQ99417 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MYCBPQ99417 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYCBPQ99417 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYCBPQ99417 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYCBPQ99417 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MYCBPQ99417 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MYCBPQ99417 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms