Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDF1Q96CC6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDF1Q96CC6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms