Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms