Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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