Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms