Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSP90AA4PQ58FG1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSP90AA4PQ58FG1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms