Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CH25H-201ENST00000371852 1686 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HECW1-IT1-201ENST00000322220 1839 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RUNX1T1-227ENST00000520724 2103 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RCAN1-214ENST00000620920 2257 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms