Protein–RNA interactions for Protein: Q1A5X7

WHAMMP3, Putative WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMP3Q1A5X7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WHAMMP3Q1A5X7 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms