Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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SGCAQ16586 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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SGCAQ16586 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SGCAQ16586 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SGCAQ16586 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SGCAQ16586 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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