Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms