Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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