Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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ITGA9Q13797 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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ITGA9Q13797 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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ITGA9Q13797 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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