Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
APOFQ13790 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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APOFQ13790 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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APOFQ13790 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
APOFQ13790 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
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