Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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