Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
SNW1Q13573 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNW1Q13573 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNW1Q13573 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNW1Q13573 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
SNW1Q13573 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNW1Q13573 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNW1Q13573 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNW1Q13573 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNW1Q13573 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNW1Q13573 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNW1Q13573 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNW1Q13573 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNW1Q13573 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNW1Q13573 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNW1Q13573 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNW1Q13573 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNW1Q13573 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNW1Q13573 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNW1Q13573 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNW1Q13573 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNW1Q13573 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.8 ms