Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms