Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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