Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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