Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms