Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XPCQ01831 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
XPCQ01831 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
XPCQ01831 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
XPCQ01831 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
XPCQ01831 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
XPCQ01831 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
XPCQ01831 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
XPCQ01831 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XPCQ01831 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XPCQ01831 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XPCQ01831 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
XPCQ01831 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
XPCQ01831 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XPCQ01831 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms