Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms