Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA4P51532 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms