Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUFMP49411 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms